*本系统功能模块、字段参数,均可结合用户实际业务需求调整,可增可减,以达到最佳业务管理流程的体验!
编号 | 模块名称 | 字段参数 |
1 | 植物基因组浏览 | 基因名称、基因位置、基因功能、序列长度、编码区域、转录本信息等 |
2 | 基因注释 | GO注释、KEGG注释、Pfam注释等 |
3 | 变异分析 | SNP类型、变异位置、变异碱基、变异频率、功能预测等 |
4 | 基因家族分析 | 基因家族名称、家族成员、家族功能、基因家族结构等 |
5 | 基因表达 | 组织表达图谱、发育阶段表达图谱、响应逆境表达图谱、差异表达分析等 |
6 | 尺度测量 | 染色体长度、染色体起始位置、染色体终止位置、GC含量、GC:skew等 |
7 | 非编码RNA分析 | miRNA预测、lncRNA预测、circRNA预测、snoRNA预测、piRNA预测等 |
8 | 基因结构预测 | 内含子预测、外显子预测、转录本预测、剪接位点预测、ORF预测等 |
9 | 基因编码能力预测 | CDS预测、可变剪接预测、蛋白质编码能力预测、翻译后修饰预测、保守位点预测等 |
10 | 基因组比对 | 多序列比对结果、同源基因比对结果、基因组结构比对结果、基因组比对质量评估等 |
11 | 基因组装 | 基因组序列组装结果、序列片段连接、Gap闭合、核酸序列修剪、碱基配对纠正等 |
12 | 同源基因预测 | 同源基因家族数量、同源基因对齐结果、同源基因功能注释、同源基因进化关系等 |
13 | 基因网络分析 | 基因相互作用网络、调控网络、KEGG信号通路、基因调控关系、蛋白质互作网络等 |
14 | 基因组注释 | SNP注释、缺失注释、插入注释、结构变异注释、重复序列注释等 |
15 | 基因组数据库连接 | NCBI数据库连接等 |
16 | 基因组数据分析 | 基因组大小分析、GC含量分析、CpG岛分析、SNP分析、缺失片段分析等 |
17 | 基因组可视化 | 基因组轨迹图、简化基因图、照片磁带图、基因组直线图、染色体地图等 |
18 | 基因组比较 | 基因组共线性分析、基因组区域差异分析、基因家族进化分析、基因结构演化分析、基因序列保守性分析等 |